Methotrexaat is nog een vrij onbekend medicijn. Toch wordt er steeds vaker MTX aan patiënten met de ziekte van Crohn en colitis ulcerosa gegeven. Dit omdat er vrijwel geen bijwerkingen bekend zijn. MTX onderdrukt in lage doseringen het afweersysteem en remt de onstekingen af. De doseringen die gebruikerlijk gegeven worden ligt tussen de 10 en de 40 miligram pet week. Het effect van Methotrexaat treedt niet meteen op maar na een paar weken. Vanaf 2 tot 3 maanden is het effect maximaal.

MTX is er als pil en als injectie. Pilvorm is het makkelijkste voor de patiënt omdat je alleen maar een pilletje hoeft te slikken en dus geen spuit moet (laten) zetten. Alleen het nadeel van een pilvorm is dat als je na het innemen van een pil MTX kaas of melkproducten nuttigt, het effect afneemt. Als je MTX spuit, geldt dit niet. Daarom wordt doorgaans ook voor de injectie gekozen.

Drink ook liever geen alcohol als je MTX gebruikt. Dit omdat MTX al een negatieve invloed heeft op je lever. De combinatie drank en MTX is dus niet echt optimaal voor je lever.

Een hele grote waarschuwing:
Wordt niet zwanger terwijl je MTX als medicijn gebruikt! Dit omdat er dan een kans bestaat dat het embryo met een geboren afwijking ter wereld komt.